Alien: Isolation on saanut päivityksen, jonka myötä pelistä löytyy nyt kaksi uutta vaikeustasoa: Novice ja Nightmare. Päivitys on ilmainen kaikilla pelialustoilla.
Nimensä mukaan Nightmare tarjoaa pelaajalle runsaasti haasteita, kuten rikkinäisellä näytöllä varustetun liikkeentunnistimen, rajallisemman määrän resursseja, pois päältä olevan karttapalvelun sekä aggressiivisemmat viholliset ─ ja tietenkin entistäkin vaarallisemman Alienin.
Novice-vaikeustasolla taas voi ottaa hieman rennommin Alienin ollessa ei-niin-aggressiivisella tuulella ja ammuksia sekä resurssejakin tulee vastaan enemmän.